Imagick::setImage() の使用例です。
<?php
/* オブジェクトを作成します */
$image = new Imagick('source.jpg');
$replace = new Imagick('replace.jpg');
/* source.jpg を replace.jpg で置き換えます */
$image->setImage($replace);
/* 画像を出力します */
header('Content-type: image/jpeg');
echo $image;
?>